En 2005 Zamartze pasa a ser la casa de espiritualidad de la diócesis de Pamplona-Tudela.

Entre los años 2010-2016 se realizaron las excavaciones en Zamartze a cargo de Aditu y la Universidad de Oxford. En estas excavaciones se realizaron un total de 330 exhumaciones medievales. Se descubre una calle porticada del S.III y se realiza el descubrimiento de una calzada romana del S.I.

Actualmente el monasterio de Zamartze se ha convertido en un punto de referencia tanto espiritual como artístico e histórico.